מוזיאון הזיכרון לשואה בליטא וגטו וילנה
ביוזמת מוזיאון הגאון להיסטוריה יהודית יפתחו בבניין ספריית גטו וילנה לשעבר את מוזיאון הזיכרון לשואה בליטא וגטו וילנה.
לפני מלחמת העולם השנייה, הבניין שנמצא ברחוב שטראשון 6 שיכן את ספריית 'מפיצי ההשכלה'. ב-1940, בימי הכיבוש הסובייטי הראשונים, הולאמה הספרייה, ובאביב 1941 אורגנה מחדש לספרייה מס' 5. לפני הקמת גטו וילנה פעל כאן היודנראט הראשון. לאחר הקמת גטו וילנה ב-6 בספטמבר 1941, הגיעה הספרייה לשטח הגטו הגדול ופעלה בו כמעט עד חיסול הגטו בספטמבר 1943. ספריית הגטו נוהלה על ידי פליט מוורשה, הביבליוגרף הרמן קרוק, שכתב יומן המכונה היום 'ימיה האחרונים של ירושלים של ליטא'. בשל מאמציה התרבותיים הפעילים, הספרייה כונתה לעתים קרובות כמרכז התרבות: היא שימשה חנות ספרים, ארכיון, לשכות סטטיסטיקה וכתובות, ואירחה אירועי תרבות.
בניין הספרייה הפך לא רק למרכז תרבות, אלא גם למקום מפגש של ארגון ההתנגדות המחתרתית FPO (ביידיש: Fareinikte partizaner organizacie (ארגון הפרטיזנים המאוחד)) שפעל בגטו. בחדר הקריאה בספרייה, החביאו חברי FPO את נשקם ולמדו כיצד להשתמש בהם, ודנו בסתר בתוכניות להמשך פעולה. בחצר הספרייה היה מגרש ספורט של הגטו, ובחזיתו בית כלא. בשנת 1944, באותו בניין הקימו ניצולי השואה, בראשות הסופרים שמרקה קצ'רגינסקי ואברהם סוצקבר, את המוזיאון היהודי, שנסגר על ידי הממשלה הסובייטית בשנת 1949. בתקופת הכיבוש הסובייטי, שכן בבניין ספריית הגטו לשעבר בית ספר טכני של ספרנים, לימים בית הספר למוזיקה של וילנה (שב-2004 שונה שמו לקונסרבטוריון). ב-28 בפברואר 2017, בניין ספריית גטו וילנה לשעבר זכה להגנה משפטית ונרשם בפנקס המורשת התרבותית כאחד המבנים המארח מוסד תרבותי של יהודי וילנה. בשנת 2018 בוצעו עבודות תיקון בבניין. ב-21 בינואר 2019, בעקבות צו מס' ĮV-21, של שר התרבות של הרפובליקה של ליטא, הבניין הוכרז כבניין תחת חסות המדינה. בשנת 2019, מוזיאון הגאון להיסטוריה יהודית הכין פרויקט השקעה מתוקן עבור מוזיאון הזיכרון לשואה בליטא וגטו וילנה. בשנת 2020 הוכן התכנון הטכני לשיפוץ המתוכנן והתיקונים הגדולים. בוצעו מחקרים ארכיאולוגיים ופוליכרומיים במבנה, והביאו לגילוי אלמנטים דקורטיביים אותנטיים. לאחר סיום עבודות הבנייה והעיצוב, מוזיאון גאון וילנה להיסטוריה יהודית יזמין את המבקרים למוזיאון הזיכרון החדש לשואה בליטא ולגטו וילנה, שיחליף את תערוכת השואה הנוכחית (רח' פמנקאלניו 12). המבקרים בתערוכה החדשה ילמדו בהרחבה על תולדות השואה בליטא ובגטו וילנה בסביבה היסטורית זו, ויראו מוצגים אותנטיים מאחזקות המוזיאון. ניתן לתרום לפרויקט של מוזיאון הזיכרון לשואה בליטא ובגטו וילנה על ידי תרומה והשאלה של מוצגים ומתן תמיכה כספית.